Justícia 2030 s'estructura entorn dels objectius (3) que es fan efectius mitjançant programes (9), tres per objectiu. Els programes es fan operatius mitjançant projectes (27). Els projectes són les unitats operatives que asseguren que s'assoleixin els objectius. Són estables durant deu anys. Amb ells es mesura l'impacte.

Els projectes poden estar formats per subprojectes, que varien en quantitat en funció de les necessitats. En aquest moment el seu nombre arriba als 47. Són les unitats d'execució, mesura i finançament. Entorn d'ells es creen els equips de treball, es fixen els terminis d'execució i es defineixen els indicadors d'impacte i evolució. Tenen caràcter finalista i no tenen vocació de permanència. Al llarg del període de vigència de Justícia 2030 aniran acabant subprojectes que poden ser substituïts per altres, en funció de les necessitats. En aquest moment el seu nombre arriba als 47.